北山林场下设党组（行政）办公室、驻县办事处、计划财务科、生产技术科、林业调查设计队、天然林资源保护工程管理办公室、护林防火办公室、林业有害生物防治检疫工作站、林业产业办公室、巴扎营林区、加定营林区十一个职能部门和种苗公司一个生产经营单位。除种苗公司财务实行单独核算外，其他单位均为报账制单位。 

林场实行场长负责制，场长是林场的法定代表人；场职工代表大会是林场实行民主管理的基本形式，是职工行使民主管理权利的机构；场长办公会议是场处理重大事务的议事机构；场务会议是场行使经营管理权和处理全场日常事务工作的议事机构，组成成员：场党组书记(场长)、副场长、党组（行政）办公室主任、驻县办事处主任、计划财务科科长、森林防火办公室主任、生产科科长、林调队队长、天保办主任、产业办主任、林业有害生物防治检疫工作站站长、巴扎营林区主任、加定营林区主任；场工会委员会是职工代表大会的工作机构，负责职工代表大会的日常工作，检查、督促职工代表大会决议的执行。